A ALIEN: Fate of the Nostromo, els jugadors assumeixen el paper dels membres de la tripulació de la Nostromo: Ripley, Lambert, Parker, Brett o Dallas. Al llarg del joc, recullen ferralla, fabriquen objectes i compleixen diferents objectius. La tripulació perdrà i guanyarà moral a mesura que es trobi amb l'alienígena i altres situacions. Si la moral de la tripulació arriba a zero, els jugadors perden la partida.

Cada torn té dues fases. A la fase d'Acció de la Tripulació, els jugadors s'arrosseguen pels passadissos del Nostromo, recollint ferralla, creant objectes, intercanviant ferralla i objectes amb altres jugadors, i utilitzant objectes i les seves habilitats especials. En Brett, per exemple, pot crear objectes amb una ferralla menys que els altres jugadors. Si l'alienígena es troba a tres espais del jugador amb l'incinerador, aquest jugador pot utilitzar l'incinerador per enviar l'alienígena de tornada al seu niu.

A la fase de Trobada, els jugadors roben i resolen una carta de Trobada. L'alienígena podria estar amagat darrere de qualsevol cantonada...

Un cop els jugadors compleixen els seus objectius inicials, s'enfronten a una de les cinc missions finals, cadascuna amb un conjunt únic de requisits. Els jugadors han de complir els requisits de la missió final simultàniament per guanyar la partida. Els jugadors també poden introduir l'oficial científic Ash per a una partida més desafiant. Ash es mou per la nau, eliminant ferralla i obligant la tripulació a perdre la moral.